Jaarlijks reikt de NKWP samen met haar Vlaamse zusterorganisatie VPW twee prijzen uit, de Els Witte Jaarprijs Politicologie voor het beste proefschrift en de Daniël Heinsiusprijs voor de beste scriptie van het voorgaande jaar. De uitreiking van de prijzen vindt plaats op het jaarlijkse politicologenetmaal, waar de winnaars respectievelijk €1000 en €500 in ontvangst mogen nemen.
Voordrachten voor de Els Witte jaarprijs kunnen worden ingediend bij de secretaris va de NKWP, Tim Mickler (deadline is 1 maart – de nominator wordt gevraagd om gebruik te maken van een nominatieformulier) en voor de Daniel Heinsiusprijs bij de secretaris van de jury van de Daniel Heinsius prijs, Emile Van Ommeren (deadline is 1 maart) voorzien van pdf-exemplaren.